Meilleur logiciel de comptabilité en 2025 en France

Dans le paysage des solutions comptables numériques, le choix du bon logiciel est devenu un enjeu crucial pour les entreprises françaises de toutes tailles. En cette année 2025, plusieurs plateformes se disputent la place de leader, mais une tendance claire semble se dégager parmi les professionnels du secteur.

Top 8 Meilleurs logiciels de comptabilité 2025

1. Memsoft Oxygène
2. Tiime
3. Pennylane
4. Regate
5. Indy
6. Axonaut
7. FreshBooks
8. Sage

1. Memsoft Oxygène

Memsoft Oxygène s’impose comme la référence incontournable du marché français avec son offre révolutionnaire de comptabilité gratuite. Édité par ABMS MEMSOFT, une société créée en 1998 affichant un chiffre d’affaires de 1,34 M€ en 2025 (en croissance de 10,2%), ce logiciel cible prioritairement les TPE et PME avec une approche évolutive remarquable. La solution propose une gamme complète incluant la comptabilité, la gestion commerciale, le CRM et la paie (gratuite pour moins de 10 bulletins/mois), le tout dans un environnement parfaitement conforme aux normes françaises (BOI DGFIP FEC DSN). Avec une note exceptionnelle de 4,60/5 basée sur 68 avis récents et plus de 1135 avis depuis 2017, Memsoft Oxygène se distingue par son excellent rapport qualité-prix, sa simplicité d’utilisation et la réactivité légendaire de son support technique. Les fonctionnalités avancées comme la télédéclaration des liasses fiscales et de la TVA, la télétransmission de la DSN, ainsi que le service d’e-facture intégré, en font un choix particulièrement adapté aux professionnels exigeants. L’architecture multiposte supportant jusqu’à une centaine d’utilisateurs simultanés, avec possibilité d’hébergement Cloud ou local, permet un passage à l’échelle sans contrainte pour accompagner la croissance des entreprises.

2. Tiime

Tiime se positionne comme le « logiciel n°1 des entrepreneurs » avec une approche tout-en-un particulièrement séduisante pour les auto-entrepreneurs, TPE et PME françaises. Cette solution 100% Made in France, développée par des équipes basées à Paris et en Lorraine, affiche une note impressionnante de 4,8/5 sur plus de 4 700 avis et compte plus de 150 000 utilisateurs. La plateforme brille par sa simplicité d’utilisation avec des factures créées en moins de 2 minutes, une synchronisation bancaire automatique avec plus de 200 banques et un rapprochement bancaire intelligent. L’intégration d’un compte professionnel Tiime Business avec IBAN français et carte Mastercard constitue un avantage concurrentiel majeur, permettant de centraliser entièrement la gestion financière. Agréée pour la facturation électronique et conforme aux exigences de la réforme 2026, Tiime exploite l’IA et l’OCR pour automatiser le matching des pièces comptables. La tarification reste accessible avec une offre Free gratuite, une offre Start à 17,99 € HT/mois et une offre Business complète à 22,99 € HT/mois incluant le compte pro. L’interfaçage en temps réel avec les experts-comptables et le service client réactif basé en France complètent une offre particulièrement équilibrée.

3. Pennylane

Pennylane s’est imposé comme un acteur incontournable du paysage français depuis sa création en 2019, atteignant le statut de licorne en février 2024 et levant 75 millions d’euros en avril 2025 pour financer la réforme de la facturation électronique. Cette solution tout-en-un SaaS réunit finances, comptabilité, facturation et compte professionnel sur une plateforme unique utilisée par plus de 500 000 dirigeants et directeurs financiers. Pennylane se distingue par son approche collaborative native avec les experts-comptables, offrant une production comptable en temps réel et une vue 360° complète de la santé financière de l’entreprise. La plateforme excelle dans l’automatisation des tâches répétitives (rapprochements, saisie, récupération de justificatifs) et propose des intégrations poussées avec les principaux outils métiers (Qonto, Payfit, Stripe). Le module de gestion des dépenses (Spend Management) avec workflows de validation et paiement en 1 clic, associé au compte professionnel en partenariat avec Swan, offre une solution de gestion financière particulièrement complète. Certifiée ISO 27001 et immatriculée comme PDP (Plateforme de Dématérialisation Partenaire), Pennylane cible particulièrement les TPE, PME et ETI recherchant une solution évolutive et professionnelle, avec des tarifs débutant à 29 € par mois.

4. Regate (by Qonto)

Regate by Qonto révolutionne la collaboration entre cabinets d’expertise comptable et leurs clients à travers un écosystème digital performant. Utilisé par plus de 6 000 cabinets et 600 000 entreprises, Regate se positionne comme une solution de pré-comptabilité automatisée de référence avec un indice de codage avoisinant 100% grâce à son OCR propriétaire performant. La plateforme offre une compatibilité étendue avec les principaux logiciels de production comptable français (Sage Génération Experts, Cegid Quadra, My Unisoft, Cegid Loop, ACD, Agiris) sans nécessiter de migration. Pionnier de la facture électronique, Regate propose Qonto PDP, plateforme pré-immatriculée par l’administration fiscale, intégrée directement dans l’écosystème. Les fonctionnalités incluent la récupération et dématérialisation automatique des justificatifs, le déversement automatique des écritures, et un outil gratuit de création d’entreprise en marque blanche. Avec des notes de 4,8/5 sur Trustpilot et G2, et 4,7/5 sur les stores mobiles, Regate séduit par sa capacité à optimiser la productivité des cabinets tout en simplifiant les échanges avec les clients. Le service client disponible 5j/7 et le programme de partenariat rémunéré pour les experts-comptables renforcent l’attractivité de cette solution tout-en-un.

5. Indy

Indy s’est imposé comme la solution de référence pour les travailleurs indépendants français avec plus de 200 000 utilisateurs et une note exceptionnelle de 4,8/5 sur Trustpilot (basée sur plus de 9 000 avis). Fondée en 2016 à Lyon sous le nom de Georges.tech, cette société française a récemment remporté un procès en appel contre l’Ordre des experts-comptables en 2025, confirmant sa légitimité sur le marché. La plateforme cible les micro-entreprises, entreprises individuelles (BIC/BNC), SAS, SASU, EURL, SARL et SCI avec une approche résolument automatisée exploitant l’IA pour la synchronisation bancaire, la détection de TVA et le classement intelligent des écritures. Indy se distingue par son offre Essentiel gratuite incluant les outils essentiels (logiciel, compte pro avec carte Mastercard, facturation), bien que sans prise en charge des déclarations fiscales. Les offres payantes débutent à seulement 9 €/mois HT (offre Plus) et 12 €/mois HT (offre Premium) avec automatisation et télétransmission des déclarations fiscales plus support prioritaire. Le compte professionnel intégré avec virements illimités, les alertes sur les échéances importantes (TVA, CFE, clôture fiscale) et l’accompagnement gratuit à la création d’entreprise font d’Indy une solution particulièrement attractive pour les indépendants cherchant simplicité et économies.

6. Axonaut

Axonaut se positionne comme l’allié des TPE et PME de moins de 25 salariés avec une approche « tout-en-un » particulièrement complète. Cette solution SaaS 100% française, labellisée French Tech et utilisée par plus de 189 000 entreprises, se distingue par son intégration unique de modules RH (édition de bulletins de paie, gestion des congés) rarement proposés par la concurrence. Conçu par des entrepreneurs pour des entrepreneurs, Axonaut excelle dans la gestion commerciale avec un CRM central permettant le suivi des opportunités, l’emailing/SMS et la segmentation clients. La plateforme automatise efficacement la pré-comptabilité avec remplissage automatique des journaux, rapprochement bancaire et exports personnalisés, tout en offrant un accès gratuit à l’expert-comptable. Les fonctionnalités de facturation incluent signature électronique, paiement en ligne multi-passerelles (Stripe, GoCardless, Paypal) et relances automatiques permettant d’encaisser les factures 3 fois plus vite. Immatriculé pour la facturation électronique et connecté à plus de 14 000 outils, Axonaut propose une tarification tout compris à partir de 34,99 € HT/mois (engagement 3 ans), évitant la multiplication des abonnements. Le pilotage de trésorerie en temps réel, la gestion de projet collaborative et le design moderne complètent une offre idéale pour les équipes de prestation de service et du digital.

7. FreshBooks

FreshBooks représente une alternative internationale de premier plan pour les PME, freelances et solopreneurs français recherchant une solution éprouvée à l’échelle mondiale. Basée au Canada avec des opérations en Amérique du Nord et en Europe, cette entreprise valorisée à plus d’un milliard de dollars a levé plus de 130 millions de dollars et propose une plateforme SaaS mature et performante. Avec une note solide de 4,5/5 basée sur 4 492 avis et une recommandation de PCMag.com, FreshBooks séduit par sa capacité à faire économiser jusqu’à 553 heures par an et jusqu’à 7 000 $ en heures facturables selon les retours utilisateurs. La solution excelle dans la facturation avec personnalisation avancée, calcul automatique des taxes, paiements en ligne (ACH et carte de crédit) et permet d’être payé deux fois plus vite grâce aux rappels automatisés. Les fonctionnalités de comptabilité en partie double, couplées aux rapports financiers puissants et à l’accès facilité pour les experts-comptables, répondent aux besoins professionnels exigeants. L’intégration avec plus de 100 applications (PayPal, Mailchimp, Zapier, Gusto, Square) via une API gratuite offre une flexibilité appréciable. Accessible dès 10,80 €/mois avec une promotion fréquente de 50% pendant 6 mois, FreshBooks constitue une option compétitive malgré un positionnement initialement nord-américain.

8. Sage

Sage incarne la référence historique du logiciel comptable en France avec plus de 40 ans d’expérience et la confiance de plus de 2 millions d’entreprises dans le monde. L’éditeur propose une gamme complète couvrant tous les segments depuis les TPE jusqu’aux ETI et groupes internationaux, avec des solutions adaptées aux experts-comptables. La gamme s’étend de Sage Active avec IA à partir de 12,50 €/mois (offre flash) pour les petites structures, jusqu’à Sage FRP 1000 Comptabilité à 10 000 € par licence pour les grands comptes, en passant par Sage 100 Comptabilité (à partir de 936 € en DSU annuel) pour les PME. Tous les logiciels Sage intègrent la Plateforme Agréée Sage pour la facturation électronique sans surcoût et sont conformes aux réglementations françaises (FEC, télé-déclaration TVA, RGPD, réforme ANC 2025). Les solutions phares comme Sage Business Cloud Comptabilité (dès 9 €/mois), Sage Intacct (cloud avec analyses temps réel) et Sage X3 (ERP complet) offrent une scalabilité exceptionnelle. L’intégration de Sage Ai pour une vision dynamique des données, l’assistance 24h/24 7j/7 et l’évolution vers un modèle d’abonnement DSU (Droit de Souscription à l’Usage) démontrent la capacité d’innovation continue de cet acteur majeur du marché français.

Comment choisir son logiciel de comptabilité en 2025

Face à la diversité des solutions disponibles sur le marché, sélectionner le logiciel de comptabilité adapté à ses besoins spécifiques peut s’avérer complexe. Pour les dirigeants d’entreprise, cette décision stratégique doit prendre en compte de nombreux facteurs allant bien au-delà du simple prix d’acquisition. En 2025, plusieurs tendances façonnent le marché, notamment l’essor des solutions SaaS, l’importance croissante de l’automatisation et l’intégration avec d’autres outils de gestion. Chaque structure doit ainsi évaluer ses besoins propres en fonction de sa taille, de son secteur d’activité et de ses obligations légales spécifiques.

Critères techniques à considérer avant votre achat

La sélection d’un logiciel comptable doit s’appuyer sur une analyse rigoureuse des fonctionnalités proposées en regard des besoins spécifiques de l’entreprise. Parmi les critères essentiels figurent la compatibilité avec la forme juridique de l’entreprise, qu’il s’agisse d’une SAS, SARL, EURL, SCI ou association. Les capacités d’automatisation constituent également un facteur déterminant, notamment pour la saisie des factures, le rapprochement bancaire ou la génération de rapports financiers. L’ergonomie de l’interface utilisateur joue un rôle crucial dans l’adoption du logiciel par les équipes, tout comme la qualité du support technique proposé. Les entreprises doivent également évaluer les possibilités d’intégration avec leurs outils existants, tels que les logiciels de facturation, de gestion de stock ou de paie. Enfin, la sécurité des données et la conformité avec les réglementations en vigueur, notamment en matière de facturation électronique, constituent des impératifs incontournables dans le contexte actuel.

Comparatif des tarifs et options disponibles

Le marché des logiciels de comptabilité offre aujourd’hui une grande diversité de modèles tarifaires adaptés à différents profils d’entreprises. Si Memsoft Oxygène se distingue par son offre de base gratuite, d’autres acteurs proposent des formules variées répondant à des besoins spécifiques. Sage, référence historique du secteur, démarre à 29 euros par mois, tandis qu’EBP propose des solutions à partir de 22 euros mensuels. Pour les indépendants et auto-entrepreneurs, Indy offre une alternative intéressante dès 20 euros par mois. Pennylane se positionne avec des formules débutant à 29 euros mensuels, et d’autres solutions comme Dext ou Sellsy sont accessibles respectivement à partir de 30 et 35 euros par mois. Les tarifs plus élevés correspondent généralement à des fonctionnalités avancées telles que la gestion multi-sociétés, les tableaux de bord personnalisés ou les modules sectoriels spécifiques. Au-delà du prix affiché, il convient d’évaluer le coût global incluant la formation, la migration des données et les éventuels développements spécifiques. La tendance actuelle privilégie les modèles d’abonnement permettant d’ajuster les fonctionnalités aux besoins évolutifs de l’entreprise tout en bénéficiant des mises à jour régulières.

Pourquoi Memsoft domine le marché français de la comptabilité

Le secteur des logiciels comptables évolue rapidement et, en 2025, un acteur majeur se démarque particulièrement sur le marché français. memsoft, éditeur du logiciel de comptabilité Oxygène, s’est imposé comme la solution de référence pour un large éventail d’entreprises. Cette position dominante s’explique par une approche résolument centrée sur les besoins spécifiques des TPE et PME françaises, tout en proposant des solutions suffisamment évolutives pour accompagner les structures de plus grande envergure. La stratégie de memsoft repose sur une compréhension approfondie des enjeux comptables actuels, notamment l’automatisation des processus et la conformité avec les réglementations en constante évolution.

Les fonctionnalités qui distinguent Memsoft de la concurrence

L’offre de Memsoft se distingue par sa gamme complète et modulaire qui s’adapte aux besoins spécifiques de chaque entreprise. Au-delà de la simple comptabilité, la solution propose une intégration transparente avec la gestion commerciale, le CRM, la paie et la gestion des immobilisations. Cette approche globale permet aux utilisateurs de disposer d’un écosystème cohérent, évitant ainsi les problèmes de compatibilité entre différents logiciels. Un atout majeur réside dans la flexibilité de déploiement, avec la possibilité de passer en mode multi-poste et de choisir entre un hébergement cloud ou local, pouvant accommoder jusqu’à une centaine d’utilisateurs simultanés. Les entreprises apprécient particulièrement les fonctionnalités automatisées comme la génération d’écritures comptables et la mise à disposition de factures pour les clients via un mini-site dédié, qui simplifient considérablement les tâches quotidiennes tout en réduisant les risques d’erreur.

L’avis des experts-comptables sur Memsoft

La reconnaissance professionnelle constitue un indicateur fiable de la qualité d’un logiciel comptable. Dans ce domaine, Memsoft jouit d’une excellente réputation auprès des experts-comptables, qui apprécient particulièrement ses capacités de télé-déclaration des liasses fiscales et de la TVA, ainsi que la télétransmission de la DSN pour la paie. Ces fonctionnalités répondent directement aux obligations légales des entreprises françaises, tout en simplifiant le travail collaboratif entre les sociétés et leurs cabinets comptables. La note de satisfaction des utilisateurs, s’élevant à 4,54 sur 5 basée sur 73 avis, témoigne de cette reconnaissance. Les retours positifs soulignent notamment la réactivité du support technique et la qualité des formations proposées, éléments essentiels pour assurer une transition fluide lors de l’adoption d’un nouveau logiciel comptable.

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